NSUN3 (NOP2/Sun RNA Methyltransferase Family Member 3) er et gen, der koder for en RNA-methyltransferase, som er involveret i modifikation af mitokondrielle tRNAs. Denne modifikation er vigtig for korrekt mitokondriel proteinsyntese og funktion. Mutationer i NSUN3 er blevet koblet til mitokondrielle sygdomme.